Đầu năm 2009 được sự chỉ đạo của chư tôn thiền đức trong Giáo hội Phật giáo tỉnh Thừa Thiên Huế, và được sự cho phép của các cấp chính quyền địa phương và sự hỗ trợ đắc lực của chư tôn đức Tăng, Ni đồng bào Phật tử trong và ngoài nước, Ni chúng trong chùa đã khởi công đại trùng tu toàn bộ ngôi chánh điện với mô hình theo mẫu chùa Huế truyền thống trùng thiềm, kiến trúc bê tông cốt thép kiên cố.
Sau hơn một năm thi công đến nay công trình trùng tu đã hoàn thành trang nghiêm bề thế, nội ngoại thất đẹp, tiền đường thờ chư vị Hộ pháp, chánh điện thờ Đức Bổn sư Thích Ca Mâu Ni Phật hai bên thờ Bồ tát Địa Tạng và Bồ tát Quán Thế Âm được đúc bằng đồng nguyên chất, hậu liêu thờ chư Ni và Phật tử chùa quá cố.
Lễ khánh tạ lạc thành an vị được tổ chức vào ngày 24.3.2010, chư tôn HT. Thích Huệ Ấn, HT. Thích Tâm Thọ; HT. Thích Lưu Hòa; HT. Thích Tánh Tịnh; HT. Thích Chơn Tế đồng GPCM BTS; HT. Thích Giác Quang, Phó Trưởng Ban Thường trực BTS GHPG TT Huế; HT. Thích Trí Hải, Phó Ban Trị sự THPG Quảng Trị cùng đông đảo chư tôn đức Tăng, Ni và Phật tử đã đến dự lễ.
Chùa Hoa Nghiêm trong ngày Lạc thành
Cung nghinh chư tôn đức tham dự
HT. Thích Giác Quang đại lao chư tôn Hòa thượng Chứng minh ban đạo từ
Chư tôn đức Tăng (ảnh trên) và chư tôn đức Ni (ảnh dưới) dự lễ trai tăng
Đại diện Ni chúng tác bạch
Đông đảo Phật tử tham dự
A.T